針對本日新聞媒體報導，臺東縣遭颱風重創修復牛步中央災後不理以及中央將補助澎湖縣蓋焚化廠兩則新聞，環保署表示，本年風災接踵而來，環保署與臺東縣環保局均保持密切聯繫與合作，並給予臺東縣最大協助，災後垃圾清理已盡最大力量幫忙協調，大型機具補助需求也加速行政程序中，中央與地方應彼此體諒；至於澎湖縣是否蓋焚化廠，環保署尊重地方政府決定與民意。
環保署表示，尼伯特颱風侵襲臺東縣期間，環保署即在第一時間派員進駐協助救災，至縣內各鄉鎮市以專人責任方式，分別至災區現勘、採取緊急應變措施、協調街道堆置廢棄物清運、環保設施勘查等工作，緊急調度大型機具及車輛達2,590輛車次（經費約1,800萬元），完成災後廢樹枝13,058公噸及家戶垃圾10,863噸清理工作，加強飲用水水質抽驗工作423件，消毒面積達2萬4,403公頃，及協調外縣市協助焚化處理災後廢棄物。
有關環保設施修復及需求部分，臺東市掩埋場修復工程已發包中，掩埋場挖土機需求已由臺東縣環保局納入花東基金內補助，其他各鄉鎮環保設施災損部分均已完成複勘、審查並獲行政院核定經費約1,543萬元；另災後大量廢樹枝問題，臺東縣向該署申請經費購置大型破碎設備，環保署已完成初核並請環保局考量實用性及災後廢樹枝破碎後的木屑供作廚餘堆肥場堆肥副資材的用途，提出最經濟且實用的修正計畫；至於臺東縣內垃圾場飽和，垃圾送請他縣市焚化處理需回運底渣或再利用產品乙節，環保署最近於本（105）年10月11日召開協調會，邀集處理端與被協助端之縣市溝通協商，以解決底渣處理問題。
對於各界關切澎湖縣設置小型焚化廠一節，垃圾處理係屬地方事務，縣市為了處理該縣市垃圾，充分運用轄內既有或興設環保設施，建置自主垃圾處理體系，中央予以肯定，必要時予以協助。至於澎湖縣焚化廠乙案，去年陳縣長曾向前魏署長表達該縣要興建焚化廠之構想，請環保署協助經費，環保署表示會予以協助。現該縣於今年離島建設基金編列預算正進行可行性評估，同時也會向縣民說明；若評估可行後需進行環評，環評通過後才會進行規畫設計相關事宜，對於本案基於地方事務，本署會尊重該縣評估與決定以及縣民的選擇。